MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16G

Total Repeats: 757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021527	CAA	2	6	106	111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846464
2	NC_021527	GTG	2	6	130	135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846464
3	NC_021527	GGT	2	6	164	169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846464
4	NC_021527	AAAT	2	8	218	225	75 %	25 %	0 %	0 %	513846464
5	NC_021527	ATC	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846464
6	NC_021527	T	6	6	252	257	0 %	100 %	0 %	0 %	513846464
7	NC_021527	GTG	2	6	292	297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846464
8	NC_021527	TTG	2	6	503	508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846465
9	NC_021527	AAG	2	6	554	559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846465
10	NC_021527	AG	3	6	612	617	50 %	0 %	50 %	0 %	513846465
11	NC_021527	CAGTT	2	10	753	762	20 %	40 %	20 %	20 %	513846465
12	NC_021527	TAG	2	6	885	890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846466
13	NC_021527	TC	3	6	896	901	0 %	50 %	0 %	50 %	513846466
14	NC_021527	TAT	2	6	1066	1071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846466
15	NC_021527	CTG	2	6	1103	1108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846466
16	NC_021527	CTC	2	6	1115	1120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	513846466
17	NC_021527	A	7	7	1134	1140	100 %	0 %	0 %	0 %	513846466
18	NC_021527	TCA	2	6	1189	1194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846466
19	NC_021527	CTG	2	6	1228	1233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846467
20	NC_021527	TGG	2	6	1250	1255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846467
21	NC_021527	TGG	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846467
22	NC_021527	AAC	2	6	1434	1439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846467
23	NC_021527	ATT	2	6	1479	1484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846467
24	NC_021527	GAT	3	9	1613	1621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846467
25	NC_021527	TTC	2	6	1758	1763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
26	NC_021527	GAC	2	6	1772	1777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846468
27	NC_021527	CAC	2	6	1784	1789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513846468
28	NC_021527	TTCC	2	8	1800	1807	0 %	50 %	0 %	50 %	513846468
29	NC_021527	AGC	2	6	1881	1886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846468
30	NC_021527	GC	3	6	1885	1890	0 %	0 %	50 %	50 %	513846468
31	NC_021527	TGA	2	6	1920	1925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846468
32	NC_021527	CTTG	2	8	2036	2043	0 %	50 %	25 %	25 %	513846468
33	NC_021527	TAA	2	6	2051	2056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846468
34	NC_021527	TAG	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846468
35	NC_021527	CAG	2	6	2105	2110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846468
36	NC_021527	GCC	2	6	2118	2123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513846468
37	NC_021527	CTT	2	6	2168	2173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
38	NC_021527	CTT	2	6	2253	2258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
39	NC_021527	TCT	2	6	2278	2283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
40	NC_021527	GTT	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846468
41	NC_021527	ATG	2	6	2344	2349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846468
42	NC_021527	ACC	2	6	2403	2408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513846468
43	NC_021527	GCA	2	6	2440	2445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846468
44	NC_021527	TGA	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846468
45	NC_021527	CTT	2	6	2502	2507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
46	NC_021527	CAA	2	6	2528	2533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846468
47	NC_021527	ATA	2	6	2551	2556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846468
48	NC_021527	AAC	2	6	2559	2564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846468
49	NC_021527	CAA	2	6	2588	2593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846468
50	NC_021527	GAA	2	6	2694	2699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846468
51	NC_021527	GCT	2	6	2741	2746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846468
52	NC_021527	GAA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846468
53	NC_021527	AGT	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846468
54	NC_021527	GGT	2	6	2856	2861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846468
55	NC_021527	TTC	2	6	2980	2985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
56	NC_021527	CTT	2	6	3020	3025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
57	NC_021527	TCT	2	6	3062	3067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
58	NC_021527	ATA	2	6	3175	3180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846468
59	NC_021527	ATT	2	6	3287	3292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846469
60	NC_021527	ATC	2	6	3309	3314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846469
61	NC_021527	TTGA	2	8	3366	3373	25 %	50 %	25 %	0 %	513846469
62	NC_021527	ATC	2	6	3375	3380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846469
63	NC_021527	TTGAA	2	10	3591	3600	40 %	40 %	20 %	0 %	513846469
64	NC_021527	TGAC	2	8	3608	3615	25 %	25 %	25 %	25 %	513846469
65	NC_021527	GCT	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846469
66	NC_021527	GCCA	2	8	3795	3802	25 %	0 %	25 %	50 %	513846469
67	NC_021527	AGC	2	6	3807	3812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846469
68	NC_021527	TTG	2	6	3845	3850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846469
69	NC_021527	AAC	2	6	3972	3977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846469
70	NC_021527	GTT	3	9	3979	3987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846469
71	NC_021527	ATG	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846469
72	NC_021527	TGC	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846469
73	NC_021527	AAC	2	6	4155	4160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846469
74	NC_021527	CAA	2	6	4205	4210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846469
75	NC_021527	AAT	2	6	4233	4238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846469
76	NC_021527	GACA	2	8	4286	4293	50 %	0 %	25 %	25 %	513846469
77	NC_021527	GTC	2	6	4320	4325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846469
78	NC_021527	CGT	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846469
79	NC_021527	AAC	2	6	4386	4391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846469
80	NC_021527	TGC	2	6	4392	4397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846469
81	NC_021527	CAA	2	6	4997	5002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846470
82	NC_021527	ACA	2	6	5020	5025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846470
83	NC_021527	TGA	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846470
84	NC_021527	ATT	2	6	5111	5116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846470
85	NC_021527	GCG	2	6	5142	5147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846470
86	NC_021527	CATG	2	8	5209	5216	25 %	25 %	25 %	25 %	513846470
87	NC_021527	ACG	2	6	5245	5250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846470
88	NC_021527	TCA	2	6	5432	5437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846470
89	NC_021527	AGC	2	6	5458	5463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846470
90	NC_021527	GCCAC	2	10	5479	5488	20 %	0 %	20 %	60 %	513846470
91	NC_021527	TGAA	2	8	5607	5614	50 %	25 %	25 %	0 %	513846470
92	NC_021527	CAA	2	6	5620	5625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846470
93	NC_021527	TCA	2	6	5658	5663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846470
94	NC_021527	AAATC	2	10	5764	5773	60 %	20 %	0 %	20 %	513846470
95	NC_021527	TGA	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846470
96	NC_021527	AT	3	6	6127	6132	50 %	50 %	0 %	0 %	513846471
97	NC_021527	AT	3	6	6146	6151	50 %	50 %	0 %	0 %	513846471
98	NC_021527	TCA	2	6	6239	6244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846471
99	NC_021527	T	6	6	6249	6254	0 %	100 %	0 %	0 %	513846471
100	NC_021527	T	6	6	6283	6288	0 %	100 %	0 %	0 %	513846471
101	NC_021527	CTT	2	6	6314	6319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846472
102	NC_021527	TTCT	2	8	6409	6416	0 %	75 %	0 %	25 %	513846472
103	NC_021527	CTA	2	6	6456	6461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846472
104	NC_021527	ATT	2	6	6525	6530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846472
105	NC_021527	AT	3	6	6538	6543	50 %	50 %	0 %	0 %	513846472
106	NC_021527	T	7	7	6568	6574	0 %	100 %	0 %	0 %	513846472
107	NC_021527	GTT	2	6	6583	6588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846472
108	NC_021527	AAG	2	6	6608	6613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846472
109	NC_021527	TCA	2	6	6648	6653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846472
110	NC_021527	TCA	2	6	6984	6989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846472
111	NC_021527	GTT	2	6	7017	7022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846472
112	NC_021527	AAT	2	6	7098	7103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846472
113	NC_021527	TTGT	2	8	7131	7138	0 %	75 %	25 %	0 %	513846472
114	NC_021527	ACC	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513846472
115	NC_021527	CAA	2	6	8069	8074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846473
116	NC_021527	GATT	2	8	8077	8084	25 %	50 %	25 %	0 %	513846473
117	NC_021527	AGTAAC	2	12	8126	8137	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	513846473
118	NC_021527	CAA	2	6	8168	8173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846473
119	NC_021527	AAG	2	6	8250	8255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846473
120	NC_021527	GTTGAC	2	12	8390	8401	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	513846473
121	NC_021527	TAT	2	6	8516	8521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846473
122	NC_021527	TGA	2	6	8527	8532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846473
123	NC_021527	CGTC	2	8	8542	8549	0 %	25 %	25 %	50 %	513846473
124	NC_021527	GTGC	2	8	8576	8583	0 %	25 %	50 %	25 %	513846473
125	NC_021527	TAC	2	6	8615	8620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846473
126	NC_021527	CGG	2	6	8634	8639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846473
127	NC_021527	CGG	2	6	8813	8818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846473
128	NC_021527	TTAA	2	8	8855	8862	50 %	50 %	0 %	0 %	513846473
129	NC_021527	TAAT	2	8	9030	9037	50 %	50 %	0 %	0 %	513846473
130	NC_021527	AAT	2	6	9254	9259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846473
131	NC_021527	GCAA	2	8	9385	9392	50 %	0 %	25 %	25 %	513846473
132	NC_021527	GTA	2	6	9408	9413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846473
133	NC_021527	ACA	2	6	9421	9426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846473
134	NC_021527	TTA	2	6	9482	9487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846473
135	NC_021527	AGA	2	6	9496	9501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846473
136	NC_021527	ACA	2	6	9514	9519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846473
137	NC_021527	TGA	2	6	9529	9534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846473
138	NC_021527	T	6	6	9914	9919	0 %	100 %	0 %	0 %	513846474
139	NC_021527	TAA	3	9	9970	9978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846474
140	NC_021527	GGC	2	6	10007	10012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846474
141	NC_021527	GTT	2	6	10040	10045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846474
142	NC_021527	TATC	2	8	10052	10059	25 %	50 %	0 %	25 %	513846474
143	NC_021527	AGA	2	6	10098	10103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846474
144	NC_021527	TTA	2	6	10130	10135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846474
145	NC_021527	AG	3	6	10162	10167	50 %	0 %	50 %	0 %	513846474
146	NC_021527	T	7	7	10198	10204	0 %	100 %	0 %	0 %	513846474
147	NC_021527	TAT	2	6	10251	10256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846474
148	NC_021527	GGTTA	2	10	10281	10290	20 %	40 %	40 %	0 %	513846474
149	NC_021527	TGG	3	9	10350	10358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846474
150	NC_021527	TTG	2	6	10434	10439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846474
151	NC_021527	TAA	2	6	10441	10446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846474
152	NC_021527	GTG	2	6	10452	10457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846474
153	NC_021527	AAT	2	6	10487	10492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846474
154	NC_021527	A	6	6	10517	10522	100 %	0 %	0 %	0 %	513846474
155	NC_021527	ACA	2	6	10587	10592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846474
156	NC_021527	TTGC	2	8	10826	10833	0 %	50 %	25 %	25 %	513846474
157	NC_021527	AAG	2	6	10950	10955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846474
158	NC_021527	GCAA	2	8	10960	10967	50 %	0 %	25 %	25 %	513846474
159	NC_021527	T	6	6	11107	11112	0 %	100 %	0 %	0 %	513846474
160	NC_021527	CAA	2	6	11436	11441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846474
161	NC_021527	CAAC	3	12	11483	11494	50 %	0 %	0 %	50 %	513846474
162	NC_021527	GAA	2	6	11495	11500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846474
163	NC_021527	TCT	2	6	11546	11551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846474
164	NC_021527	ACT	2	6	11870	11875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846474
165	NC_021527	CAA	2	6	12065	12070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846474
166	NC_021527	CAAA	2	8	12189	12196	75 %	0 %	0 %	25 %	513846474
167	NC_021527	GAG	2	6	12230	12235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513846474
168	NC_021527	TGA	2	6	12265	12270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846474
169	NC_021527	ATG	2	6	12312	12317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846474
170	NC_021527	TGA	2	6	12520	12525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846474
171	NC_021527	TGG	2	6	12600	12605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846475
172	NC_021527	ACCT	2	8	12612	12619	25 %	25 %	0 %	50 %	513846475
173	NC_021527	CAAA	2	8	12622	12629	75 %	0 %	0 %	25 %	513846475
174	NC_021527	GC	3	6	12702	12707	0 %	0 %	50 %	50 %	513846475
175	NC_021527	T	7	7	12708	12714	0 %	100 %	0 %	0 %	513846475
176	NC_021527	GTC	2	6	12729	12734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846475
177	NC_021527	GTA	2	6	12738	12743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846475
178	NC_021527	TGA	2	6	12801	12806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846475
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249	NC_021527	TAT	2	6	16734	16739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846478
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253	NC_021527	TG	3	6	16820	16825	0 %	50 %	50 %	0 %	513846478
254	NC_021527	TAAA	2	8	16834	16841	75 %	25 %	0 %	0 %	513846478
255	NC_021527	GCGA	2	8	16890	16897	25 %	0 %	50 %	25 %	513846478
256	NC_021527	ATT	2	6	16915	16920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846478
257	NC_021527	ATTGTG	2	12	16959	16970	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	513846478
258	NC_021527	TAA	2	6	16991	16996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846478
259	NC_021527	TGGCA	2	10	17025	17034	20 %	20 %	40 %	20 %	513846478
260	NC_021527	TAT	2	6	17045	17050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846478
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